加拉帕戈斯象龟一年中的任何时间都可以繁殖，但在潮湿的高地，在雨季的2月至6月是高峰期加拉帕戈斯陆龟。成熟的雄性在交配季节将会显示自己的优势，它们用粗壮的腿站立起来，舒展长长的脖子，偶尔会发生头撞和口咬，但通常较短的时间就可以确定交配的权利，承认胜利者。交配的前奏非常积极，雄性有力地用自己外壳压住雌龟并咬住它的腿。伸展四肢并紧张地保持一个倾斜的位置。雄性的外壳凹底面帮助它平衡，雄龟将泄殖腔发泄口（容纳阴茎）接近雌龟的扩张泄殖腔。在交配时，雄性用嘶哑的有节奏的呻吟发声，其他的声音也都在积极接触中发生。在繁殖季的7月至11月，成龟的行程长达数公里，以达到干燥和沙质海岸的筑巢地区。挖巢是一个累人和复杂的任务，雌龟每天要干几个小时，这可能需要多天才能完成。它们先用后肢挖一个30厘米深的圆柱形洞，然后产下16枚硬壳卵，重量从82到157克，产卵后雌龟将巢洞用泥泞的土壤和尿液混合后塞住，用它的腹甲压实密封，然后由太阳进行自然孵化和培养。雌龟可能在每个繁殖季要挖1-4个卵巢。温度对幼体的性别起着绝对性作用，在较低的温度下筑巢会生产出更多的雄性，较高温度下的筑巢会生产更多的雌性。加拉帕戈斯象龟在15岁左右时可以鉴别性别，大约在20-25年达到性成熟，在野外40年才能到达成体的标准尺寸。在野外的预期寿命超过100年，是动物王国中寿命最长的物种之一。保存在澳大利亚动物园的标本——哈里特，是已知最古老的加拉帕戈斯陆龟，在2006年她去世时，估计年龄超过170年。